空調的水系統結垢如果采用強腐蝕性酸洗除垢對空調系統危害很大
1.強腐蝕性酸洗會腐蝕金屬，損傷主機，使設備提前報廢，就會縮短了空調的壽命，酸洗技術室借助著強腐蝕性的酸溶解空調中的污垢，但是由于空調水系統是多材質體系的，酸對金屬會強烈的化學腐蝕，這樣就會讓空調的使用壽命縮短。
2.由于酸洗容易造成空調的系統金屬腐蝕損傷，損傷室內的裝修材料，增加空調設備的維修費用，雖然是輕度的損傷，但是多次酸洗后的空調系統在運行一段時間后也會因為腐蝕損傷而頻繁維修和更換損傷零部件，這樣就會大大增加系統維修費用。如果對賓館，酒店，寫字樓的空調維修系統酸洗不當會造成管路腐蝕泄漏，泄漏的酸洗液會損傷室內的裝飾，維修泄漏管道或者更換損傷部件都會導致對室內環境的裝修，空調用戶不僅要支付設備損傷部分的維修更換費用，還要付出對室內重新裝修的更多費用，影響正常經營和辦公。這些費用和損失會是酸洗工程款的數倍。
3.酸洗只能把空調系統內的碳酸鹽水垢去除，對于硫酸鹽及硅質性污垢無法去除，在清洗后空調系統內留下大量無法去除的污垢，除垢不。這樣在清洗以后也會影響空調的制冷和制熱的效率。
4.停機清洗需要改變空調的運行參數。
5.酸洗溶液中含有大量的劇毒和強腐蝕性的化學物質，COD和BOD值都超過環保指標的幾百倍甚至是幾千倍。酸洗溶液的廢液對花草植物和水生物都具有危害性。很多清洗公司為了降低成本會對酸洗溶液的廢液直接排放不做任何的處理，對生態環境造成了影響和破壞。
空調主機冷凝器和蒸發器管壁都很薄，強腐蝕性的酸洗液容易將管壁腐蝕穿孔，損傷嚴重會導致主機當時報廢。近年來，國內已發生多起由于酸洗不當導致價值近千萬元的空調系統洗完即報廢的清洗事故。綜上所述，由于空調維修設備及制冷劑的特殊性，所以不宜采用傳統清洗技術。